1961年，列宁的遗体又开始了腐烂，而此时，为列宁遗体专职服务了近四十年的兹巴尔斯基教授已经去世，他的接班人在遗体紧急防腐处理方面的经验不足，因而束手无策。于是，赫鲁晓夫同医务人员商定，把暂时未腐烂的头部同躯干分开，至此列宁的躯干被火化，而头部则被安装到人造躯干模型上，“手术”相当成功，所有的参观民众丝毫也没有察觉。
前苏联解体以后，1997年4月，在列宁诞生日前后，围绕著他遗体的问题又发生了激烈争论，民（和谐？）主派主张将遗体移出红场，左派则强调列宁墓是克里姆林宫的一部份，受联合国教科文组织的保护，不得随意变动。直至现在，列宁墓周围经常有一些非参观者的人在走动，据说这是俄国共（和谐？）产党的自愿者，他们轮流为列宁墓放哨，以防不测事件发生。俄罗斯政（和谐？）府虽然没有正式表态，但却来了个釜底抽薪，停止为护理列宁遗体拨款，并将列宁墓实验室更名为“生物结构研究中心”。